AIP wird oft im Zusammenhang mit einer Eliminations- und Provokationsdiät genannt, bei der man sich für einen Monat lang nach dem AIP-Konzept ernährt und dann Schritt für Schritt verschiedene Lebensmittel einzeln wieder einführt, um so zu testen, auf welche Lebensmittel der Körper reagiert. Verspürt man eine Reaktion, meidet man das Lebensmittel zukünftig, verspürt man keine Symptome, kann man das Lebensmittel wieder zu sich nehmen.

Dieses Vorgehen funktioniert, wenn man testen möchte, ob man z.B. auf Lektine oder Nachtschattengewächse reagiert. Allerdings muss an dieser Stelle erwähnt werden, dass es schwierig ist, etwaige auftretende Symptome dem Konsum eines Nahrungsmittels sicher zuzuordnen, denn 

• die Symptome können mit einigen Tagen Verzug einsetzen 
• oder im ersten Moment für einen gar nicht spürbar sein (z.B. eine schmerzlose Entzündung der Schilddrüse wie bei Hashimoto der Fall). 
• Zudem gibt es mehrere Ursachen oder Trigger, die zu demselben Symptom führen können, z.B. kann eine allgemeine Müdigkeit durch den Konsum eines unverträglichen Nahrungsmittels oder einfach durch schlechten Schlaf hervorgerufen werden.

Eine Alternative zu der Elimations- und Provokationsdiät und eine sichere Möglichkeiten um Nahrungsmittelsensitivitäten auf einzelne Lebensmittel und Proteine wie Lektine zu diagnostizieren bietet Cyrex Array 10. Er testet 180 Lebensmittel sowohl in gekochter wie roher Form und ist weltweit führend hinsichtlich seiner Genauigkeit. Von billigen Nahrungsmitteltests ist abzuraten, da hier False Positives wie auch False Negatives auftreten können.